Acanthofanax gracilistylus is een loofende plant in de familie Araliaceae, die veel gebruikt wordt in de Chinese kruidengeneeskunde, omdat de wortelschors functies heeft om de lever en de nieren te voeden, vocht te verwijderen en wind uit te stoten, en de beenderen en pezen te versterken. Kaurenoic acid (KA) is de belangrijkste effectieve stof in de wortelschors van A. gracilistylus met sterke anti-inflammatoire effecten. Om het KA-biosynthesepad te belichaamden werden de sequenties van de tweede generatie (DNA nanoball) en de derde generatie (Pacific Biosciences) uitgevoerd om de transcriptomes van de A. gracilistylus-bladeren, wortels en stammen te analyseren. Van de 505,880 isoforms werden er 408,954 geannoteerd door zeven grote databases. Zestig isoforms met volledige open leesframes die 11 sleutelenzymen coderen die betrokken zijn bij het KA-biosynthesepad werden geïdentificeerd. Correlatieanalyse tussen isoform-expressie en KA-inhoud identificeerde in totaal acht belangrijke genen. Zes belangrijke enzym genen betrokken bij KA biosynthese werden gevalideerd door real-time kwantitatieve polymerase kettingreactie. Op basis van de sequentieanalyse werd de ruimtelijke structuur van ent-kaureen-oxidase gemodelleerd, die rollen speelt in de drie continue oxidatiestappen van KA-biosynthese. Deze studie verrijkt de transcriptome-gegevens van A. gracilistylus enorm en vergemakkelijkt verdere analyse van de functie en het regelmechanisme van sleutelenzymen in het KA-biosynthesepad. Acanthofanax gracilistylus is een loofende plant in de familie Araliaceae, die veel gebruikt wordt in de Chinese kruidengeneeskunde, omdat de wortelschors functies heeft om de lever en de nieren te voeden, vocht te verwijderen en wind uit te stoten, en de beenderen en pezen te versterken. Kaurenoic acid (KA) is de belangrijkste effectieve stof in de wortelschors van A. gracilistylus met sterke anti-inflammatoire effecten. Om het KA-biosynthesepad te belichaamden werden de sequenties van de tweede generatie (DNA nanoball) en de derde generatie (Pacific Biosciences) uitgevoerd om de transcriptomes van de A. gracilistylus-bladeren, wortels en stammen te analyseren. Van de 505,880 isoforms werden er 408,954 geannoteerd door zeven grote databases. Zestig isoforms met volledige open leesframes die 11 sleutelenzymen coderen die betrokken zijn bij het KA-biosynthesepad werden geïdentificeerd. Correlatieanalyse tussen isoform-expressie en KA-inhoud identificeerde in totaal acht belangrijke genen. Zes belangrijke enzym genen betrokken bij KA biosynthese werden gevalideerd door real-time kwantitatieve polymerase kettingreactie. Op basis van de sequentieanalyse werd de ruimtelijke structuur van ent-kaureen-oxidase gemodelleerd, die rollen speelt in de drie continue oxidatiestappen van KA-biosynthese. Deze studie verrijkt de transcriptome-gegevens van A. gracilistylus enorm en vergemakkelijkt verdere analyse van de functie en het regelmechanisme van sleutelenzymen in het KA-biosynthesepad.